ヒバは他の木材に比べ、木材腐朽菌やシロアリに対する耐久性が優れていることで知られ、ヒバ林の多い青森地方では家屋の柱や板材、土台などによく使われています。青森ヒバを土台に使えば、殺蟻剤や防腐剤を使用する必要がないとまで言われているくらいです。
　ヒバの強い抗菌作用は、ヒノキチオールという成分によるものです。ヒノキチオールは、カビや木材腐朽菌のほか、病原菌を抑える力もあります。院内感染の原因となる病原菌MRSAや、食中毒の猛威を奮う大腸菌O157に対しても抗菌作用があります。 MRSAに対しては現在、病院の床掃除に使用するなどの方法で抗菌力の持続性の試験が行われています。ヒノキチオールは主に、医薬部外品として養毛剤、化粧品、歯磨きなどに使用されています。
　天然由来の食品添加物は“化学的合成品以外の食品添加物リスト”の中に記載・指定され、表示が義務づけられていますが、平成３年、そのリストにヒノキチオールも保存料として新たに記載されました。これにより、ヒノキチオールの食品添加物としての用途が開けつつあります。